General Seminars

Dinamica interactiunii proteazei de tip rhomboid cu membrana lipidica

by Ana-Nicoleta Bondar (University of California at Irvine, USA), Stephen H. White (University of California at Irvine, USA)

Monday, 5 May 2008 from to (Europe/Bucharest)
at Măgurele ( Marius Petrașcu Seminar Room )
Description
Proteazele intramembranare sunt componente esentiale ale celulelor biologice care elibereaza din membrane substraturi de importanta fundamentala pentru fiziologia celulara (spre exemplu, pentru controlul transcriptiei, boala Alzheimer, infectia cu virusul hepatitei C). Proteaza intramembranara de tip rhomboid GlpG din bacteria Escherichia Coli are o suprafata iregulara, si activitatea ei proteolitica este influentata de caracteristicile fizico-chimice ale membranei lipidice in care se afla. Mai mult decat atat, mutatii la interfata dintre proteaza si membrana lipidica au un efect dramatic asupra activitatii de proteoliza. Metodele experimentale pot furniza doar informatii limitate asupra structurii si dinamicii interactiunilor dintre membrane lipidice si proteine. De aceea, calculele de dinamica moleculara au o importanta deosebita pentru ca pot furniza imagini la detaliu atomic a proteinelor intramembranare incorporate in membrana lipidica. Voi prezenta o scurta introducere in medodologia calculelor de dinamica moleculara pentru proteine membranare si voi discuta rezultatele principale ale studiilor noastre pe proteaza rhomboid din Escherichia Coli. Rezultatele noastre permit intelegerea efectului compozitiei membranei lipidice asupra activitatii de proteoliza si a efectului mutatiilor la interfata dintre proteaza si membrana lipidica.